文章摘要:赪桐作为药用和观赏价值兼备的林下植物具有较高的应用价值，但其基因的转录信息较少。本研究基于PacBio Sequel?测序平台开展赪桐根、茎、叶、花等组织部位的全长转录组测序，共获得31 368条转录本序列，利用Nr、KEGG、COG/KOG和SwissProt四大数据库共注释到30 473个基因。根据GO功能注释，分别有109 844条GO条目参与生物过程，75 764条参与细胞组分，28 724条参与分子功能。通过KEGG数据库分析，共有9 681条序列参与了138条代谢通路，其中有4 653条序列参与了43条次生代谢产物合成路径。全长转录组通过注释，预测到CDS序列31 368个，662个转录因子，5 405个跨膜蛋白，6 066个SSR，749个lncRNA。赪桐全长转录组的数据注释与分析，为研究赪桐基因功能、代谢通路调控及基因表达分析等提供了理论基础。

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项目基金:《分子植物育种》 网址: http://www.fzzwyzzz.cn/qikandaodu/2021/1223/610.html