刊名:分子植物育种
主办:海南省生物工程协会
主管:海南省科学技术会
ISSN:1672-416X
CN:46-1068/S
语言:中文
周期:半月
影响因子:0.803252
数据库收录:
北大核心期刊(2011版);北大核心期刊(2014版);北大核心期刊(2017版);农业与生物科学研究中心文摘;化学文摘(网络版);中国科学引文数据库(2011-2012);中国科学引文数据库(2013-2014);中国科学引文数据库(2015-2016);中国科学引文数据库(2017-2018);中国科学引文数据库(2019-2020);日本科学技术振兴机构数据库;中国科技核心期刊;期刊分类:农艺学
期刊热词:
研究报告
文章摘要:目的 应用分子生物学鉴定技术,筛选出应用于鉴定钩藤属物种的最佳DNA条形码,建立快速、准确、便捷的钩藤属植物鉴定方法。方法本研究从广东、广西等地收集了8个钩藤属物种的叶片、茎枝作为实验材料,共计44份样品。提取样品总DNA,分别对条形码ITS、matK、psbA-trnH、rbcL、trnL-trnF序列进行扩增、测序、拼接、校对;利用MEGA7.0分析比对序列特征;基于TaxonDNA计算种内、种间的遗传距离以分析barcodinggap及BestMatch、BestCloseMatch评估DNA条形码的鉴别能力;使用MEGA7.0、Phylosuite等软件构建单条形码及组合条形码的最大似然法(MaximumLikelihood,ML)、最大简约法(MaximumParsimony,MP)、贝叶斯推断法(Bayesianinference,BI)系统发育树。结果 条形码ITS、matK、psbA-trnH、rbcL、trnL-trnF序列均扩增成功且具有较高的测序成功率,其中psbA-trnH具有最多的变异位点,ITS次之,rbcL最少;BestMatch、BestCloseMatch与Barcodinggap分析结果显示:5个单一条形码中,ITS鉴定钩藤属物种效果突出且具有明显的Barcodinggap,而组合条形码ITS+rbcL序列表现更为优异。基于所有单一条形码构建的系统发育树,ITS序列的物种鉴别成功率最高,能够准确鉴定8个钩藤属物种;基于组合条形码构建的系统发育树,ITS+rbcL序列具有最高的平均节点支持率,且该序列集包含的11个钩藤属物种均能单独聚为一支。结论应用ITS+rbcL的序列组合能够实现钩藤属不同物种的准确鉴定。
文章关键词:
论文分类号:R282.5
文章来源:《分子植物育种》 网址: http://www.fzzwyzzz.cn/qikandaodu/2022/0125/623.html
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